幽门螺杆菌检查，常用胃黏膜组织活检进行快速尿素酶试验、革兰染色镜检及10％CO2分离培养。
如果培养阳性即可确诊。据研究认为该菌与以下疾病有关。
阳性见于消化性溃疡：
胃及十二指肠黏膜分离培养阳性率分别为57%～85%及86%～96%；
慢性胃炎：胃黏膜分离培养阳性率85%；
十二指肠炎：分离培养阳性率高，如果在活动期可高达100%。
