鉴别诊断：当3个月以内婴儿出现出血症状时，根据喂养史，所患疾病及使用药物史，应首先考虑本病。若应用维生素K后，出血症状于24小时内迅速改善，凝血酶原时间恢复正常，则可以确定诊断。
若本病仅出现颅内出血症状，而不伴有其他部位出血表现时，易误诊为颅内感染如脑炎、脑膜炎等疾病。本病起病突然，病前无明显感染中毒症状，贫血发展迅速而严重，脑脊液呈血性，结合实验室检查与对维生素K治疗的反应，均有别于颅内感染性疾病。
此外，尚需与先天性凝血因子缺乏性疾病如血友病等鉴别，后者有反复出血史，或家族成员中有类似病史，以及各病特有的实验室检查特点，可资鉴别。
